Journal entry

Suppose  salary  to Mr  X  is  50000/- , so  Advance  paid  40%  is  20000/-    

J. E  will be 

Advance  Salary  to  X   A/c   Dr              20000/- 

To   Bank                       A/c    Cr                                   20000/-              

(  Payment  of Advance  Salary )                     

Advance Salary  A/c  under loans &  advances  asset  side  balance sheet 

Entry  for  Balance   Salary  payment  with  deductions  of  ESIC  &  EPF   as no  deductions  were made at time of advance salary as per your query . 

J.E   as per above   example  

Booking  entry 

Salary      A/c                              Dr         50000/- 

To Salary  Payable  to X  A/c     Cr                          50000/- 

(  Salary  payable  ) 

Payment entry 

Salary  payable to X A/c                         Dr         50000/- 

To  Advance  Salary  to Mr  X   A/c       Cr                                   20000/- 

To  Bank   A/c                                        Cr                                     25800/-            

To   EPF    A/c                                        Cr                                      2850/-         

To ESIC     A/c                                        Cr                                     1350/- 

(  Balance salary   paid after  deductions form  balance  salary  ) 

Payment  of  ESIC  &  PF  to  GOVT  account 

EPF        A/c                                       Dr          2850/- 

ESIC      A/c                                       Dr           1350/-

To      Bank   A/c                                 Cr                          4200/-

( Being payment of  EPF  &  ESIC  to GOVT  account )